其实相比之下，绒毛穿刺是最安全的，因为该穿刺是对胎盘进行穿刺而不是胎儿，穿刺针不进入胎儿生活的环境---羊膜腔。所以，对胎儿基本没有影响。
但与平时打屁股针一样同样是存在感染的风险。感染就会导致流产。这种发生率对一个技术熟练的医生大概是0.1%-0.05%。所以胎儿亲子鉴定的安全性和可靠性是毋庸置疑的，孕妇应该根据自己的情况，决定是做还是不做，是做绒毛亲子鉴定还是抽羊水亲子鉴定。
还有一种无创静脉血的亲子鉴定，更加是不用担心它的安全性了，绝对的安全，抽取的是孕妇的静脉血。
怀孕期间做DNA亲子鉴定，需要怀孕5周以上，B超确认符合要求。抽取准妈妈手臂静脉血10ml，假定父亲5ml血液（或带毛囊头发，精液，口腔黏膜）做DNA亲子鉴定检测。7个工作日出鉴定结果。肯定亲子关系的准确率可达到99.99%，否定亲子关系的准确率100%。
对十几至几十个DNA位点作检测，如果全部一样，就可以确定亲子关系，如果有3个以上的位点不同，则可排除亲子关系。7个工作日出鉴定结果。肯定亲子关系的准确率可达到99.99%，，否定亲子关系的准确率100%。
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